HPCIを利用する研究課題は公募により選ばれます。
主に大学や公的研究機関における研究開発が対象になる「一般課題」、主に民間企業の研究開発が対象になる「産業利用課題」は、年度ごとに定期募集が行われています（「富岳」は年に2回の定期募集）。
「本格的に利用する前に試してみたい」などの利用の検討段階のニーズに応える随時募集の課題もあります。
また、HPCIは研究成果を公開することを必須条件に無償で利用ができます。研究成果を公開しない課題は有償で随時募集しています。
HPCIの利用
